33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0105 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0105  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  295  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0317  thiamineS protein  35.71 
 
 
93 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.114297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0722  thiamineS protein  35.71 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290197  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1679  thiamineS protein  36.78 
 
 
98 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0808  MoaD family protein  33.33 
 
 
92 aa  57  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0744  thiamineS  34.94 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.822098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4177  thiamineS protein  35.37 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547124  normal  0.802197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3986  thiamineS protein  35.71 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.71 
 
 
480 aa  53.9  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3300  thiamineS protein  34.52 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.330741  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0950  thiamineS protein  33.33 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0937  MoaD family protein  33.33 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771117  normal  0.577382 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1688  thiamineS protein  29.76 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000869432  hitchhiker  0.00000468877 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0115  MoaD family protein  28.57 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3192  MoaD family protein  35.71 
 
 
90 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325536  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1845  thiamineS protein  34.12 
 
 
91 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4204  thiamineS protein  30.12 
 
 
92 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.975285  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.76 
 
 
364 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0802  thiamineS protein  32.14 
 
 
92 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.954228  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0227  hypothetical protein  32.14 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.861343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4953  thiamineS  29.41 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1847  thiamineS protein  42.47 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1540  MoaD family protein  27.38 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8912  molybdopterin synthase subunit MoaD  30.95 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3578  thiamineS protein  33.73 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732018  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1727  molybdopterin synthase subunit MoaD  28.57 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.974961  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0723  hypothetical protein  31.51 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142051  normal  0.344384 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3606  thiamineS protein  34.52 
 
 
91 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0390874  normal  0.0482836 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2353  thiamineS protein  32.56 
 
 
93 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426187  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3647  thiamineS protein  33.73 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1003  MoaD family protein  35.14 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.183154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8124  thiamineS protein  27.38 
 
 
91 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2369  hypothetical protein  27.38 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>