35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5871 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5871  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  100 
 
 		 363 aa  712    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845489  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2998  hypothetical protein  50.45 
 
 		 337 aa  295  9e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3131  hypothetical protein  48.52 
 
 		 337 aa  292  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470644  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2543  hypothetical protein  50.32 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2240  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  53.1 
 
 		 392 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2027  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  55.41 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2502  hypothetical protein  52.4 
 
 		 347 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3259  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  51.76 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.543921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5416  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  53.5 
 
 		 388 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2636  acyl-CoA dehydrogenase  49.68 
 
 		 347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292935  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2652  acyl-CoA dehydrogenase  50.5 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.685897 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4937  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  48.87 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1801  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  40.68 
 
 		 362 aa  218  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.162926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0202  hypothetical protein  42.44 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499323  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0512  hypothetical protein  44.23 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  decreased coverage  0.000000311595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2567  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  44.48 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752192  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20110  hypothetical protein  40.18 
 
 		 382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252423  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0335  hypothetical protein  40.13 
 
 		 341 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3272  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  41.46 
 
 		 396 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000123433  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0021  dehydrogenase  44.3 
 
 		 313 aa  159  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0555  hypothetical protein  39.45 
 
 		 350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01080  hypothetical protein  38.26 
 
 		 372 aa  139  7.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0138  cyclic nucleotide-binding protein  32.99 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363055  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3848  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.29 
 
 		 391 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.680066 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3593  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.1 
 
 		 385 aa  96.3  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4305  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  31.6 
 
 		 412 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0499711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4157  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  31.6 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0737881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3329  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.55 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4098  acyl-CoA dehydrogenase  27.84 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.461592  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1346  hypothetical protein  29.66 
 
 		 364 aa  76.3  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0806475  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2922  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  23.95 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0575  Acyl-CoA dehydrogenase  27.53 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0796  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  28 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585612  normal  0.628725 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1231  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  30.15 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.279686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.87 
 
 		 410 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>