26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4784 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4784  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 580 aa  1152    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370329  normal  0.538612 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4093  twin-arginine translocation pathway signal  61.01 
 
 		 583 aa  590  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.139116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4735  amine oxidase  58.92 
 
 		 582 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5265  amine oxidase  55.48 
 
 		 543 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0250  hypothetical protein  45.37 
 
 		 562 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3715  twin-arginine translocation pathway signal  37.15 
 
 		 550 aa  269  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697054  normal  0.0792167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1568  twin-arginine translocation pathway signal  32.34 
 
 		 536 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0112  FAD dependent oxidoreductase  35.44 
 
 		 487 aa  261  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0699636 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4801  hypothetical protein  35.14 
 
 		 539 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.717214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4274  hypothetical protein  35.13 
 
 		 539 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3472  hypothetical protein  34.77 
 
 		 539 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4894  hypothetical protein  34.77 
 
 		 539 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0815  hypothetical protein  34.05 
 
 		 539 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5392  hypothetical protein  34.77 
 
 		 539 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3305  hypothetical protein  32.88 
 
 		 555 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0711795  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3462  hypothetical protein  33.28 
 
 		 556 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4119  amine oxidase  33.2 
 
 		 540 aa  200  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.0166866 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4231  amine oxidase  33.2 
 
 		 540 aa  200  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05692  putative transmembrane protein  33.45 
 
 		 540 aa  195  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04763  hypothetical protein  33.45 
 
 		 540 aa  195  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0365  hypothetical protein  32.78 
 
 		 644 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0591662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  39.44 
 
 		 447 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  37.5 
 
 		 394 aa  43.9  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1544  amine oxidase  24.08 
 
 		 504 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268529 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  37.18 
 
 		 435 aa  43.5  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  37.84 
 
 		 499 aa  43.5  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>