26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2222 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2222  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  236  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0184232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2580  hypothetical protein  63.46 
 
 
108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.982918  normal  0.647309 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3457  hypothetical protein  64.42 
 
 
108 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5280  hypothetical protein  63.46 
 
 
108 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3547  hypothetical protein  63.46 
 
 
108 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3972  hypothetical protein  63.46 
 
 
108 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4236  hypothetical protein  49.5 
 
 
110 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0189  hypothetical protein  51.46 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1789  hypothetical protein  38.32 
 
 
112 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0393743  normal  0.306376 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1485  hypothetical protein  39.05 
 
 
112 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.239267  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1791  hypothetical protein  39.05 
 
 
112 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.222427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1851  hypothetical protein  38.32 
 
 
112 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.756946  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1666  hypothetical protein  38.32 
 
 
112 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0750434 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3402  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.58 
 
 
112 aa  90.5  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4641  hypothetical protein  41.77 
 
 
106 aa  67  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4448  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.63 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0592  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.53 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0132  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.29 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0140  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.29 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1855  jemb  26.6 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.37 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.449956  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4312  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1802  hypothetical protein  25.53 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0282  hypothetical protein  28.71 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  30.85 
 
 
356 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  35.62 
 
 
356 aa  40  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.788403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>