15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1666 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1851  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  237  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.756946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1666  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  237  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0750434 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1791  hypothetical protein  99.11 
 
 		 112 aa  236  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.222427 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1789  hypothetical protein  98.21 
 
 		 112 aa  234  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0393743  normal  0.306376 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1485  hypothetical protein  98.21 
 
 		 112 aa  233  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.239267  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2222  hypothetical protein  38.32 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184232 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0189  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  87  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5280  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3972  hypothetical protein  31.48 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3547  hypothetical protein  31.07 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2580  hypothetical protein  31.07 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.982918  normal  0.647309 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3402  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.7 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4641  hypothetical protein  27.85 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>