14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0987 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0987  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  484  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305876 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0028  hypothetical protein  38.21 
 
 		 317 aa  158  9e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0275  hypothetical protein  33.61 
 
 		 311 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2384  hypothetical protein  36.16 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.857348  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2943  hypothetical protein  40.76 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1670  hypothetical protein  30.16 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244551  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5599  hypothetical protein  28.63 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000732573  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1444  hypothetical protein  30.93 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1576  hypothetical protein  28.65 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2020  hypothetical protein  27.84 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8422  hypothetical protein  27.12 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0887  hypothetical protein  28.79 
 
 		 136 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4114  hypothetical protein  25 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1107  hypothetical protein  25.71 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0628147  normal  0.0453857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>