25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4744 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4744  CheW protein  100 
 
 
175 aa  341  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001523 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4346  CheW protein  25.95 
 
 
170 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.214979  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4286  CheW protein  25.95 
 
 
170 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1016  CheW protein  33.05 
 
 
160 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130392  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  29.56 
 
 
182 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2779  CheW protein  28.3 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3338  CheW protein  28.3 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  31.25 
 
 
152 aa  55.5  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3777  CheW protein  28.17 
 
 
157 aa  54.7  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1063  CheW protein  41.51 
 
 
164 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  hitchhiker  0.0000389195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0507  CheW protein  34.27 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  27.12 
 
 
176 aa  47.8  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  22.7 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1424  CheW protein  44.68 
 
 
191 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.27097  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3746  CheW protein  27.27 
 
 
174 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  28 
 
 
199 aa  44.7  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2794  CheW protein  30.77 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  27.78 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  28.57 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0857  CheW protein  31.75 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.201526  normal  0.0222726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0414  CheW protein  22.78 
 
 
171 aa  42.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557744  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4951  CheW protein  30 
 
 
175 aa  42.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  26.19 
 
 
166 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  24.83 
 
 
169 aa  42  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4604  CheW protein  24.5 
 
 
182 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.447747 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>