22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4049 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4049  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  180  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0425  hypothetical protein  35.62 
 
 
81 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2301  hypothetical protein  31.25 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.962162  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0319  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  39.71 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0753  hypothetical protein  35.14 
 
 
79 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000530744 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0093  hypothetical protein  34.25 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3462  hypothetical protein  34.62 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00193289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1314  hypothetical protein  40.3 
 
 
75 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000587692  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0837  hypothetical protein  31.51 
 
 
77 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00554204  hitchhiker  0.000686175 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1372  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  38.46 
 
 
69 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0431  hypothetical protein  30.26 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2081  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  32.05 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.410496  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1832  hypothetical protein  26.58 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0324574  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0495  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  32.35 
 
 
74 aa  44.3  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  35.42 
 
 
667 aa  44.3  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  37.5 
 
 
645 aa  44.3  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  37.5 
 
 
645 aa  44.3  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  30.99 
 
 
653 aa  43.9  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0205  hypothetical protein  27.16 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247949  normal  0.166868 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  25.32 
 
 
569 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02080  hypothetical protein  25.71 
 
 
80 aa  40.8  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  32.61 
 
 
666 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>