26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0604 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  100 
 
 
801 bp  1588    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  100 
 
 
801 bp  1588    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  100 
 
 
801 bp  1588    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5115    100 
 
 
3897 bp  1818    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  100 
 
 
801 bp  1588    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  100 
 
 
801 bp  1588    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  100 
 
 
801 bp  1588    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  100 
 
 
801 bp  1588    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  100 
 
 
801 bp  1588    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  100 
 
 
801 bp  1588    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  100 
 
 
801 bp  1588    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  100 
 
 
801 bp  1588    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  100 
 
 
801 bp  1588    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0604    100 
 
 
1752 bp  3473    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  100 
 
 
801 bp  1588    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  100 
 
 
801 bp  1588    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2629    100 
 
 
823 bp  58  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2734    87.27 
 
 
1974 bp  54  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0716494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4423    96.67 
 
 
818 bp  52  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.227705  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  96.67 
 
 
826 bp  52  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2051    96.67 
 
 
827 bp  52  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.294544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  96.67 
 
 
826 bp  52  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1220    96.67 
 
 
1955 bp  52  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000904356  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0694    96.55 
 
 
395 bp  50.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4297    96.55 
 
 
825 bp  50.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  96.55 
 
 
814 bp  50.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>