18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2550 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2550  glycosyl transferase  100 
 
 		 327 aa  669    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1521  mannosyltransferase OCH1 related enzyme  41.23 
 
 		 233 aa  166  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000001768  normal  0.448905 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1167  polysaccharide biosynthesis protein CpsM(V)  41.36 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.10639  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2395  glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD motif  37.16 
 
 		 243 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00816  hypothetical protein  32.09 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.898614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0203  hypothetical protein  25 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00360  conserved hypothetical protein  28.15 
 
 		 540 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2764  hypothetical protein  26 
 
 		 765 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.419382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0322  mannosyltransferase OCH1-related enzyme  22.61 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47117  predicted protein  28.37 
 
 		 743 aa  53.1  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47110  predicted protein  29.79 
 
 		 907 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0847586  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0318  hypothetical protein  24.2 
 
 		 314 aa  50.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42721  predicted protein  24.83 
 
 		 773 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0270  mannosyltransferase OCH1-related enzyme  26.09 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26056  predicted protein  24 
 
 		 717 aa  46.6  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.100829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0658  hypothetical protein  36 
 
 		 519 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  0.0369536 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06534  MIPC synthasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7ZA39]  26.06 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0266  hypothetical protein  24.11 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>