22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2590 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2590  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  229  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56970  hypothetical protein  38.46 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6221  protein of unknown function DUF190  38.32 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580477  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1947  hypothetical protein  34.31 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12973  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4620  hypothetical protein  37 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1487  hypothetical protein  37 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1755  hypothetical protein  32.35 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1126  hypothetical protein  29.25 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0771  hypothetical protein  29.91 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0770  hypothetical protein  34.02 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4678  hypothetical protein  31.13 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0864136 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2525  hypothetical protein  25.49 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5577  hypothetical protein  31.68 
 
 
107 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0811  hypothetical protein  28.71 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1563  hypothetical protein  34.38 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4618  hypothetical protein  26.17 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1484  hypothetical protein  26.17 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1037  hypothetical protein  32.5 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.271549  normal  0.172234 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0902  hypothetical protein  27.96 
 
 
102 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01044  hypothetical protein  30.67 
 
 
83 aa  41.6  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06122  hypothetical protein  30.67 
 
 
83 aa  41.6  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0924  hypothetical protein  26.88 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>