17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2278 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  89.38 
 
 
880 aa  1117    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2278  hypothetical protein  100 
 
 
631 aa  1280    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.262759  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  25.23 
 
 
856 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  22.36 
 
 
852 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  25.54 
 
 
893 aa  95.5  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3481  hypothetical protein  21.11 
 
 
671 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.278924 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  22.82 
 
 
947 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  22.82 
 
 
947 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  22.29 
 
 
947 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02058  hypothetical protein  23.35 
 
 
832 aa  73.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224791  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  21.47 
 
 
853 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  21.4 
 
 
953 aa  65.1  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  21.4 
 
 
870 aa  64.3  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  24.71 
 
 
862 aa  57  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  20.15 
 
 
858 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  20.15 
 
 
858 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  23.02 
 
 
875 aa  49.7  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>