25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2123 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2123  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
350 aa  711    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.887263  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0516  glycosyl transferase group 1  48.59 
 
 
360 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.869562  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3631  glycosyl transferase, group 1  47.13 
 
 
363 aa  300  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1606  glycosyl transferase, group 1  48.41 
 
 
357 aa  276  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.444102  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2229  hypothetical protein  41.18 
 
 
353 aa  248  8e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330354 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2466  glycosyl transferase group 1  43.31 
 
 
390 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0984  glycosyl transferase group 1  37.54 
 
 
364 aa  193  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1530  glycosyl transferase, group 1  39.17 
 
 
380 aa  192  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2035  glycosyltransferase  40.31 
 
 
390 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2458  glycosyltransferase-like protein  40.44 
 
 
378 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1759  glycosyltransferase-like protein  40.06 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2289  glycosyl transferase group 1  38.44 
 
 
380 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582583 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2856  glycosyltransferase-like protein  37.19 
 
 
376 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1696  glycosyl transferase group 1  39.49 
 
 
366 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1403  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
393 aa  162  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 
406 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3644  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
478 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102527  decreased coverage  0.0000773484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0157  hypothetical protein  40 
 
 
357 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
411 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1421  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
399 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
772 aa  44.3  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0959  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
388 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0276  glycosyl transferase group 1  21.71 
 
 
342 aa  43.9  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.949437  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
1243 aa  43.9  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3310  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
368 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.173139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>