16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6597 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6597  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
199 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2131  cation-transporting ATPase  39.13 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  34.21 
 
 
894 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  25 
 
 
814 aa  45.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0691  Heavy metal transport/detoxification protein  28 
 
 
82 aa  45.1  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  31.88 
 
 
861 aa  45.1  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  31.51 
 
 
839 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  32 
 
 
108 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28495  copper-transporting P-type ATPase  24.14 
 
 
804 aa  42.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105447  normal  0.5687 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03117  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  32.47 
 
 
1211 aa  42.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.208489  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82776  copper-transporting P1-type ATPase  36.51 
 
 
1214 aa  42  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1251  heavy metal translocating P-type ATPase  30.77 
 
 
806 aa  42.4  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000992397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  30.3 
 
 
69 aa  42  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  34.29 
 
 
820 aa  42  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  30.86 
 
 
102 aa  41.6  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10677  P1B, P type ATPase  28.79 
 
 
883 aa  41.6  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.704376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>