61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4686 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4686  protein of unknown function DUF92 transmembrane  100 
 
 
247 aa  482  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.347886  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0626  hypothetical protein  33.2 
 
 
470 aa  98.2  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135738  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0072  hypothetical protein  33.18 
 
 
236 aa  96.3  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.813723  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1722  hypothetical protein  34.33 
 
 
408 aa  95.9  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1343  hypothetical protein  37.77 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2383  protein of unknown function DUF92 transmembrane  33.33 
 
 
259 aa  89  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1453  hypothetical protein  30.99 
 
 
252 aa  85.5  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4898  protein of unknown function DUF92 transmembrane  30.37 
 
 
250 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0669  hypothetical protein  30.63 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0343323  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07241  hypothetical protein  31.87 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1190  hypothetical protein  32.19 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.402529  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07221  hypothetical protein  30.05 
 
 
247 aa  82  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.341372  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2624  hypothetical protein  33.03 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3310  integral membrane protein  31.2 
 
 
451 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4223  hypothetical protein  30.09 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.381218  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1287  hypothetical protein  35.88 
 
 
248 aa  79  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3466  protein of unknown function DUF92 transmembrane  31.08 
 
 
248 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.871121  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3253  protein of unknown function DUF92 transmembrane  36.27 
 
 
440 aa  79  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0257  hypothetical protein  30.59 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1334  hypothetical protein  37.18 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35069  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14261  hypothetical protein  34.05 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07261  hypothetical protein  28.57 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.124635  normal  0.0102759 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2637  protein of unknown function DUF92 transmembrane  30.14 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0101  hypothetical protein  28.57 
 
 
247 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1341  hypothetical protein  36.88 
 
 
237 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2185  protein of unknown function DUF92 transmembrane  37.8 
 
 
430 aa  75.9  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0972552  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0619  hypothetical protein  36.88 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.675202  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07421  hypothetical protein  31.37 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1500  hypothetical protein  28.81 
 
 
391 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2608  hypothetical protein  35.12 
 
 
252 aa  75.1  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07821  hypothetical protein  37.11 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598038 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1227  protein of unknown function DUF92 transmembrane  34.88 
 
 
447 aa  72.4  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.741673  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2065  protein of unknown function DUF92 transmembrane  30.69 
 
 
421 aa  72.4  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5597  predicted protein  29.02 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1546  protein of unknown function DUF92 transmembrane  31.63 
 
 
448 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5222  protein of unknown function DUF92 transmembrane  28.89 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0855  hypothetical protein  29.47 
 
 
526 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0192  protein of unknown function DUF92 transmembrane  31.14 
 
 
447 aa  65.5  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23959  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3558  hypothetical protein  29.15 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523152  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0743  protein of unknown function DUF92 transmembrane  27.09 
 
 
525 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0893181  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1573  hypothetical protein  29.35 
 
 
399 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2165  protein of unknown function DUF92 transmembrane  28.08 
 
 
526 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.937448  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10054  predicted protein  34.88 
 
 
259 aa  62.8  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0532  hypothetical protein  30.77 
 
 
401 aa  62  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.461547 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08260  conserved hypothetical protein TIGR00297  30.85 
 
 
281 aa  59.7  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0746  protein of unknown function DUF92 transmembrane  27.37 
 
 
521 aa  59.3  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.213381 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0610  membrane protein  27.98 
 
 
526 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0189  protein of unknown function DUF92 transmembrane  31.77 
 
 
257 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1715  protein of unknown function DUF92 transmembrane  26.24 
 
 
509 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_006686  CND01270  conserved hypothetical protein  30.88 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.824166  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0829  hypothetical protein  36.36 
 
 
273 aa  57.8  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0182  hypothetical protein  28.97 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.649357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1824  hypothetical protein  29.6 
 
 
306 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1927  protein of unknown function DUF92 transmembrane  26.05 
 
 
277 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000291197  hitchhiker  0.00000025153 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1205  hypothetical protein  31.19 
 
 
245 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38754  predicted protein  27.95 
 
 
195 aa  48.9  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_6328  predicted protein  26.98 
 
 
274 aa  46.2  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.171794  hitchhiker  0.00792458 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4884  hypothetical protein  28.34 
 
 
273 aa  45.4  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1613  hypothetical protein  27.59 
 
 
298 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2266  protein of unknown function DUF92 transmembrane  31 
 
 
516 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3203  hypothetical protein  34.78 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>