22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4480 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4480  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5365  hypothetical protein  52.08 
 
 		 219 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1153  high-affinity nickel-transporter  27.75 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.608233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3876  high-affinity nickel-transporter  26.52 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2766  urease accessory protein  26.48 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1851  high-affinity nickel-transporter  26.18 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0801332  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1392  hypothetical protein  28.44 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14811  hypothetical protein  29.86 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.716818  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3913  high-affinity nickel-transporter  25.45 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3875  putative urease accessory protein  26.91 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3212  high-affinity nickel-transporter  28.11 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0923  high-affinity nickel-transporter  25.64 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458788 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14951  hypothetical protein  28.44 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0225  transport-associated protein  25.23 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1254  urease accessory protein  26.34 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.735612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04681  hypothetical protein  24.76 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.668858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1750  hydrogenase accessory protein or high-affinity nickel-transport protein homolog, membrane protein  25.97 
 
 		 222 aa  48.5  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19751  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0679603 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2044  hypothetical protein  23.15 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.150592  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13431  hypothetical protein  28.64 
 
 		 221 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27426  P-ATPase family transporter: cadmium/zinc ion; heavy metal translocating P-type ATPase family-like protein  33.71 
 
 		 997 aa  43.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.040121  normal  0.339459 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43009  NiCoT family transporter: nickel ion; high affinity nickel transporter-like protein  33.71 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0978739  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>