13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3006 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3006  YD repeat protein  100 
 
 		 1263 aa  2610    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1097  YD repeat protein  26 
 
 		 1229 aa  176  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.791752  unclonable  0.0000000000274764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1394  YD repeat protein  30.57 
 
 		 1129 aa  159  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2667  YD repeat-containing protein  29.34 
 
 		 1152 aa  158  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3730  YD repeat-containing protein  29.34 
 
 		 1152 aa  158  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0100146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4144  YD repeat protein  25.65 
 
 		 1092 aa  152  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  0.283099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4640  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1322 aa  152  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.963654  normal  0.0174413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1049  YD repeat protein  27.99 
 
 		 1084 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3186  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1079 aa  146  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.187937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2121  YD repeat protein  28.26 
 
 		 1837 aa  138  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0873035  normal  0.943874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4387  hypothetical protein  32.42 
 
 		 1056 aa  127  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95296  hitchhiker  0.00457818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2075  YD repeat protein  25.28 
 
 		 1129 aa  90.9  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7100  YD repeat protein  25.09 
 
 		 1065 aa  72  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>