12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2075 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2075  YD repeat protein  100 
 
 		 1129 aa  2310    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3186  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1079 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.187937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3006  YD repeat protein  25.38 
 
 		 1263 aa  94.7  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4640  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1322 aa  90.9  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.963654  normal  0.0174413 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2667  YD repeat-containing protein  25.25 
 
 		 1152 aa  85.9  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3730  YD repeat-containing protein  25.25 
 
 		 1152 aa  85.9  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0100146  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1049  YD repeat protein  24.02 
 
 		 1084 aa  84.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1097  YD repeat protein  24.19 
 
 		 1229 aa  82.8  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.791752  unclonable  0.0000000000274764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4144  YD repeat protein  23.59 
 
 		 1092 aa  72.4  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  0.283099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4387  hypothetical protein  22.81 
 
 		 1056 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95296  hitchhiker  0.00457818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1394  YD repeat protein  41.25 
 
 		 1129 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2121  YD repeat protein  29.5 
 
 		 1837 aa  56.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0873035  normal  0.943874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>