31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2644 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2644  microcompartments protein  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1056  microcompartments protein  69.12 
 
 		 217 aa  314  8e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0893  ethanolamine utilization protein EutL  75.23 
 
 		 217 aa  313  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0072  microcompartments protein  74.77 
 
 		 217 aa  309  2e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1298  microcompartments protein  61.75 
 
 		 217 aa  278  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4864  microcompartments protein  57.01 
 
 		 215 aa  249  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1242  microcompartments protein  56.13 
 
 		 218 aa  248  7e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1222  microcompartments protein  53.99 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3669  putative ethanolamine utilization protein EutL  53.52 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2594  putative ethanolamine utilization protein EutL  53.05 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4032  microcompartments protein  58.69 
 
 		 218 aa  232  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2725  putative ethanolamine utilization protein EutL  53.05 
 
 		 219 aa  232  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1240  microcompartments protein  53.05 
 
 		 219 aa  232  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.407797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2576  putative ethanolamine utilization protein EutL  53.05 
 
 		 219 aa  232  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2811  putative ethanolamine utilization protein EutL  53.05 
 
 		 219 aa  232  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02339  predicted carboxysome structural protein with predicted role in ethanolamine utilization  53.05 
 
 		 219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02301  hypothetical protein  53.05 
 
 		 219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2649  putative ethanolamine utilization protein EutL  53.05 
 
 		 219 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2716  ethanolamine utilization protein EutL  53.05 
 
 		 219 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.823551  normal  0.898819 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2690  ethanolamine utilization protein EutL  53.05 
 
 		 219 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0908127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2601  putative ethanolamine utilization protein EutL  53.05 
 
 		 219 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2823  putative ethanolamine utilization protein EutL  53.05 
 
 		 219 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2216  propanediol utilization protein PduB  26.86 
 
 		 270 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2262  propanediol utilization protein PduB  26.86 
 
 		 270 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.124484 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2162  propanediol utilization protein PduB  26.86 
 
 		 270 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2375  propanediol utilization protein PduB  26.86 
 
 		 270 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2209  propanediol utilization protein PduB  26.86 
 
 		 270 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.129626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0906  polyhedral shell protein, EutL/PduB type  28.09 
 
 		 280 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.633495  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0209  microcompartments protein  26.29 
 
 		 271 aa  42.4  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1954  microcompartments protein  24.57 
 
 		 265 aa  42.4  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2280  propanediol utilization protein PduB  24.57 
 
 		 233 aa  42  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.428567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>