43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2615 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2615  hypothetical protein  100 
 
 		 508 aa  976    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1143  protein of unknown function DUF1538  66.06 
 
 		 497 aa  657    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150487  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0323  hypothetical protein  49.27 
 
 		 481 aa  405  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0750362  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0908  protein of unknown function DUF1538  40 
 
 		 507 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0017  hypothetical protein  38.13 
 
 		 620 aa  291  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000261883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1786  protein of unknown function DUF1538  37.68 
 
 		 545 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0836999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0342  protein of unknown function DUF1538  45.04 
 
 		 253 aa  200  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510639 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3466  hypothetical protein  25.45 
 
 		 495 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1088  protein of unknown function DUF1538  27.75 
 
 		 506 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0659  hypothetical protein  27.88 
 
 		 503 aa  193  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201808 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0474  hypothetical protein  41.98 
 
 		 245 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0746  hypothetical protein  42.41 
 
 		 243 aa  177  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0127316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0802  protein of unknown function DUF1538  27.96 
 
 		 503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0341  protein of unknown function DUF1538  41.59 
 
 		 230 aa  163  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766414 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1723  protein of unknown function DUF1538  39.78 
 
 		 288 aa  162  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0338  hypothetical protein  40 
 
 		 246 aa  157  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322383  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0101  hypothetical protein  27.61 
 
 		 601 aa  143  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0475  hypothetical protein  38.81 
 
 		 230 aa  141  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0337  hypothetical protein  34.56 
 
 		 232 aa  128  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0876004  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0745  hypothetical protein  34.98 
 
 		 231 aa  125  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189103  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3139  membrane spanning protein  31.96 
 
 		 242 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2761  hypothetical protein  32.14 
 
 		 263 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.0518932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1952  hypothetical protein  30.67 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0800  protein of unknown function DUF1538  25.47 
 
 		 497 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1827  hypothetical protein  30.92 
 
 		 261 aa  105  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0165  membrane protein  27.84 
 
 		 261 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1592  hypothetical protein  29.22 
 
 		 261 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2272  hypothetical protein  29.51 
 
 		 255 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000140028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3684  hypothetical protein  31.33 
 
 		 248 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1953  hypothetical protein  29.37 
 
 		 245 aa  100  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1220  hypothetical protein  30.7 
 
 		 244 aa  99  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.210254 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1498  hypothetical protein  26.46 
 
 		 262 aa  97.4  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.660987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3685  hypothetical protein  26.91 
 
 		 269 aa  97.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2271  hypothetical protein  31.74 
 
 		 245 aa  97.1  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00372269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1591  hypothetical protein  31.58 
 
 		 244 aa  95.9  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1826  hypothetical protein  31.62 
 
 		 244 aa  93.6  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.299788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2762  hypothetical protein  31.47 
 
 		 244 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  normal  0.055304 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1497  hypothetical protein  31.2 
 
 		 244 aa  91.7  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1221  ABC transporter for copper permease protein  27.27 
 
 		 264 aa  90.9  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2378  hypothetical protein  26.55 
 
 		 646 aa  90.5  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0164  membrane protein  29.49 
 
 		 244 aa  83.2  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.634614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3479  hypothetical protein  26.61 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3478  hypothetical protein  25.93 
 
 		 255 aa  69.7  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>