14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2023 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2023  band 7 protein  100 
 
 
658 aa  1332    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0142  band 7 protein  55.95 
 
 
673 aa  695    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5721  band 7 protein  49.24 
 
 
681 aa  633  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0977085  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7215  hypothetical protein  50.24 
 
 
659 aa  612  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7328  band 7 protein  48.19 
 
 
660 aa  591  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.081025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2967  hypothetical protein  36.46 
 
 
689 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1605  band 7 protein  32.4 
 
 
691 aa  321  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.608323  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5247  band 7 protein  32.4 
 
 
691 aa  321  3e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2133  band 7 protein  33.81 
 
 
647 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1093  band 7 protein  31.54 
 
 
650 aa  307  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.807858  normal  0.192088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0317  band 7 protein  30.62 
 
 
646 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0083  Band 7 protein  29.03 
 
 
830 aa  238  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.148744  hitchhiker  0.00195276 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  33.09 
 
 
1204 aa  184  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3347  band 7 protein  29.78 
 
 
539 aa  87.4  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.953991  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>