76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1516 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1516  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  100 
 
 		 269 aa  551  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0739061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2774  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.58 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000890852  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1321  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.69 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3013  putative selenate reductase subunit YgfM  27.27 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02675  hypothetical protein  26.88 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02713  predicted oxidoreductase  26.88 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3206  putative selenate reductase subunit YgfM  26.88 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0812  selenate reductase, FAD-binding subunit  26.48 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4170  putative selenate reductase subunit YgfM  26.48 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3040  putative selenate reductase subunit YgfM  26.48 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0828  putative selenate reductase subunit YgfM  24.62 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0473  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  26.32 
 
 		 276 aa  62  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2204  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  26.69 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0765762  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2023  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  27.01 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5317  putative carbon monoxide dehydrogenase medium subunit, coxM-like protein  26.47 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.410133 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1733  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  27.12 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2646  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  25.45 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4325  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  27.8 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.266023  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4200  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  23.02 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.690695 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2960  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  23.68 
 
 		 265 aa  52  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23003  hitchhiker  0.00916715 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1784  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  25.18 
 
 		 272 aa  52.4  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0530  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  24.73 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2185  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  23.19 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.27538  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2457  oxidoreductase  32.43 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0538765  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0594  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  24.45 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4005  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  24.28 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0077  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  22.76 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1959  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  26.76 
 
 		 294 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1633  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  23.95 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.431069  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1632  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  26.12 
 
 		 283 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2153  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.62 
 
 		 292 aa  49.7  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  25.2 
 
 		 485 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3677  carbon monoxide dehydrogenase medium subunit  26.09 
 
 		 268 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2434  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.95 
 
 		 333 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5443  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  23.66 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0609  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  27.24 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.515011  normal  0.94537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5684  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  26.91 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2836  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  23.61 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0853655  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1783  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  26.09 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.400558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0200  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  27.16 
 
 		 298 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1638  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  23.16 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.921721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0974  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  24.1 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00101197  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0060  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  23.88 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1751  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  22.96 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179717  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0448  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  25.09 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.221209  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3309  oxidoreductase, molybdopterin-binding subunit  30.95 
 
 		 333 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.493498  normal  0.0240409 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  24.1 
 
 		 485 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1155  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  25.17 
 
 		 518 aa  46.2  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2949  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  24.26 
 
 		 273 aa  45.8  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000190078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3104  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.73 
 
 		 285 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0450134  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2002  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  26.97 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3074  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  23.59 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2837  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  25.56 
 
 		 288 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2606  carbon-monoxide dehydrogenase  24.43 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2958  putative xanthine dehydrogenase  25.53 
 
 		 483 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0528227 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2097  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  25.39 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185965  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2698  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  23.42 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0195145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  26.8 
 
 		 488 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2522  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.97 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0488436  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1525  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  23.7 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0759  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.33 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.819289  normal  0.0980153 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0299  glyceraldehyde oxidoreductase medium chain  24.23 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  27.45 
 
 		 488 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  23.21 
 
 		 493 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2224  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  22.6 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.844941  hitchhiker  0.000850669 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1035  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.04 
 
 		 506 aa  43.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1562  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  24.37 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.915322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3355  putative hydroxylase molybdopterin-containing subunit  26.96 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  24.53 
 
 		 487 aa  42.7  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  23.74 
 
 		 485 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2764  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  26.35 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000220689  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4284  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  31.36 
 
 		 329 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0836  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  23.17 
 
 		 304 aa  42.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0893  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  25.69 
 
 		 498 aa  42.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366411  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0363  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  24.68 
 
 		 266 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4485  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.08 
 
 		 335 aa  42  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>