15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1063 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1063  hypothetical protein  100 
 
 
1263 aa  2574    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107018  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3563  hypothetical protein  39.59 
 
 
690 aa  524  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  32.29 
 
 
1409 aa  83.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  34.09 
 
 
2457 aa  71.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3869  fibronectin type III domain-containing protein  32.95 
 
 
1431 aa  70.5  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.849627  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0631  hypothetical protein  23.68 
 
 
906 aa  68.2  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.835872 
 
 
-
 
NC_002950  PG0476  yngK protein  24.57 
 
 
515 aa  55.1  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09991  hypothetical protein  20.12 
 
 
410 aa  53.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.573849 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0321  protein of unknown function DUF187  22.68 
 
 
911 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.140793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3463  hypothetical protein  23.31 
 
 
1099 aa  52.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.639127  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0983  xylanase/chitin deacetylase-like  30.39 
 
 
830 aa  49.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6128  FenI protein  24.37 
 
 
533 aa  49.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0784566  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0182  hypothetical protein  28.95 
 
 
1440 aa  47  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  29.6 
 
 
1300 aa  46.2  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1593  protein of unknown function DUF187  29.81 
 
 
486 aa  46.2  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>