17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0781 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0781  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  478  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2995  hypothetical protein  42.15 
 
 
217 aa  179  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0852  hypothetical protein  32.89 
 
 
224 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0868  hypothetical protein  32.89 
 
 
224 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  40.58 
 
 
366 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3077  protein of unknown function DUF955  54.55 
 
 
196 aa  50.1  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  32.74 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  29.05 
 
 
386 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4678  protein of unknown function DUF955  32.04 
 
 
184 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  47.5 
 
 
416 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1586  protein of unknown function DUF955  29 
 
 
129 aa  44.3  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.764217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  25.34 
 
 
283 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  32.61 
 
 
171 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  46.15 
 
 
349 aa  43.5  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  58.97 
 
 
362 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  33 
 
 
352 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  33.73 
 
 
372 aa  42  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>