21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0478 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0442  hypothetical protein  58.26 
 
 		 667 aa  783    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.57789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0478  hypothetical protein  100 
 
 		 656 aa  1332    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.522287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0498  hypothetical protein  43.99 
 
 		 678 aa  536  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1996  hypothetical protein  44.2 
 
 		 673 aa  528  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0495  hypothetical protein  42.46 
 
 		 687 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.591683  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1687  hypothetical protein  43.56 
 
 		 692 aa  488  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0543  hypothetical protein  38.13 
 
 		 686 aa  445  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3878  hypothetical protein  27.85 
 
 		 705 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6882  hypothetical protein  25.04 
 
 		 669 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.448154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2537  hypothetical protein  25.31 
 
 		 675 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1497  hypothetical protein  24.28 
 
 		 685 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.559508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5160  hypothetical protein  24.25 
 
 		 692 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.307901 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2457  hypothetical protein  24.89 
 
 		 663 aa  137  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1174  hypothetical protein  27.54 
 
 		 658 aa  124  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1977  hypothetical protein  31.63 
 
 		 668 aa  98.6  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1484  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  53.19 
 
 		 194 aa  47.4  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03051  late competence protein (DNA binding and uptake)  36.51 
 
 		 105 aa  46.2  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.724355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1257  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  42.86 
 
 		 219 aa  45.8  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791854  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1689  DNA uptake protein and related DNA-binding protein-like protein  38.1 
 
 		 329 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.71012 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1699  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  41.82 
 
 		 181 aa  44.7  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1756  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  36.23 
 
 		 181 aa  44.3  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>