17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0442 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0478  hypothetical protein  58.26 
 
 
656 aa  769    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.522287  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0442  hypothetical protein  100 
 
 
667 aa  1361    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.57789  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0498  hypothetical protein  41.79 
 
 
678 aa  499  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1996  hypothetical protein  42.9 
 
 
673 aa  488  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0495  hypothetical protein  41.32 
 
 
687 aa  477  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.591683  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1687  hypothetical protein  41.28 
 
 
692 aa  452  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0543  hypothetical protein  37.2 
 
 
686 aa  412  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3878  hypothetical protein  26.29 
 
 
705 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6882  hypothetical protein  25.81 
 
 
669 aa  163  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.448154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5160  hypothetical protein  26.06 
 
 
692 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.307901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2537  hypothetical protein  25.4 
 
 
675 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2457  hypothetical protein  25.85 
 
 
663 aa  145  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1497  hypothetical protein  21.96 
 
 
685 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.559508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1174  hypothetical protein  25.08 
 
 
658 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1977  hypothetical protein  28.98 
 
 
668 aa  68.6  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2544  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  30.69 
 
 
121 aa  44.3  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.644466  normal  0.0231779 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1756  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  30.51 
 
 
181 aa  43.9  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>