24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0360 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0360  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  407  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0611863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2610  hypothetical protein  46.24 
 
 		 192 aa  157  6e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0334  hypothetical protein  45.74 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.804201  normal  0.829767 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1211  hypothetical protein  43.48 
 
 		 189 aa  153  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.174889  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0260  hypothetical protein  45.05 
 
 		 197 aa  153  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0029368  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0338  hypothetical protein  44.32 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0278088  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1924  hypothetical protein  42.54 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.88 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1232  hypothetical protein  31.85 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0815  hypothetical protein  25 
 
 		 127 aa  50.1  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0265  hypothetical protein  29.87 
 
 		 143 aa  48.9  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0984626  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2695  hypothetical protein  28.21 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1424  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  48.5  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149794  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0267  hypothetical protein  29.87 
 
 		 143 aa  48.5  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0194677  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0479  protein of unknown function DUF123  29.17 
 
 		 134 aa  48.1  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0625  hypothetical protein  25.66 
 
 		 119 aa  46.2  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0898  protein of unknown function DUF123  27.33 
 
 		 137 aa  45.8  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0253075  normal  0.780245 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0858  hypothetical protein  30.41 
 
 		 165 aa  45.8  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  24.05 
 
 		 356 aa  45.1  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.95 
 
 		 356 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.95 
 
 		 356 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.88 
 
 		 356 aa  43.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0654  protein of unknown function DUF123  28.03 
 
 		 136 aa  42  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3196  protein of unknown function DUF123  27.39 
 
 		 141 aa  42  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>