15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0887 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0887  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  289  9e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8422  hypothetical protein  37.5 
 
 
204 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2943  hypothetical protein  39.17 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1107  hypothetical protein  33.04 
 
 
246 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0628147  normal  0.0453857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4114  hypothetical protein  32.14 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1444  hypothetical protein  34.59 
 
 
221 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2384  hypothetical protein  36.36 
 
 
218 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.857348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1670  hypothetical protein  36.9 
 
 
244 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244551  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2020  hypothetical protein  31.06 
 
 
212 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0987  hypothetical protein  28.79 
 
 
234 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.305876 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1576  hypothetical protein  29.41 
 
 
209 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5599  hypothetical protein  36.25 
 
 
243 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000732573  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0028  hypothetical protein  26.24 
 
 
317 aa  47  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3356  hypothetical protein  29.17 
 
 
110 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0240082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0275  hypothetical protein  29.5 
 
 
311 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>