36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1518 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1518  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
347 aa  718    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.215036  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0030  hypothetical protein  36.09 
 
 
364 aa  232  6e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.549525 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1766  putative homoserine kinase type II  35.88 
 
 
359 aa  230  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3874  aminoglycoside phosphotransferase  35.24 
 
 
355 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2269  aminoglycoside phosphotransferase  40.29 
 
 
352 aa  226  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.788221  normal  0.0258017 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0358  aminoglycoside phosphotransferase  34.67 
 
 
354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0363  aminoglycoside phosphotransferase  34.67 
 
 
354 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0356  aminoglycoside phosphotransferase  34.67 
 
 
354 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0366  aminoglycoside phosphotransferase  34.67 
 
 
354 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0364  hypothetical protein  34.49 
 
 
346 aa  222  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1410  MdsC protein  35.52 
 
 
368 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.280569  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0339  aminoglycoside phosphotransferase  35.33 
 
 
358 aa  217  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7005  aminoglycoside phosphotransferase  35.43 
 
 
348 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000158499  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0269  hypothetical protein  35.16 
 
 
354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3627  aminoglycoside phosphotransferase  34.2 
 
 
365 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0570  hypothetical protein  34.75 
 
 
370 aa  210  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3610  aminoglycoside phosphotransferase  33.71 
 
 
354 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0333  aminoglycoside phosphotransferase  33.71 
 
 
354 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.320004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4578  aminoglycoside phosphotransferase  36.63 
 
 
355 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000313167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3807  aminoglycoside phosphotransferase  33.52 
 
 
354 aa  205  9e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3494  aminoglycoside phosphotransferase  34.62 
 
 
354 aa  199  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.794585 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0729  aminoglycoside phosphotransferase  32.78 
 
 
385 aa  194  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.272999 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0367  aminoglycoside phosphotransferase  32.85 
 
 
356 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2100  aminoglycoside phosphotransferase  31.15 
 
 
382 aa  185  9e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.624576  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0655  hypothetical protein  34.53 
 
 
361 aa  183  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1142  aminoglycoside phosphotransferase  28.49 
 
 
372 aa  176  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655934  normal  0.0113624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3260  aminoglycoside phosphotransferase  26.27 
 
 
382 aa  175  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0868  hypothetical protein  28.61 
 
 
365 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.877924  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3431  aminoglycoside phosphotransferase  31.85 
 
 
402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13281  hypothetical protein  26.23 
 
 
371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1795  hypothetical protein  24.52 
 
 
376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156742  normal  0.0804022 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0860  hypothetical protein  24.26 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.350344  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07491  hypothetical protein  23.56 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193823  normal  0.063089 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0081  hypothetical protein  23.42 
 
 
387 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.201712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5808  aminoglycoside phosphotransferase  23.65 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451965  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07051  hypothetical protein  21.46 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>