21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0461 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0461  protein of unknown function DUF450  100 
 
 		 151 aa  312  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2919  hypothetical protein  62.33 
 
 		 150 aa  201  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11283  hypothetical protein  59.18 
 
 		 157 aa  191  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2421  hypothetical protein  50.34 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0367  protein of unknown function DUF450  47.95 
 
 		 147 aa  153  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1250  protein of unknown function DUF450  45.58 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344127  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_002950  PG0947  hypothetical protein  44.67 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.138847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1807  protein of unknown function DUF450  43.84 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.648369  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1440  hypothetical protein  39.6 
 
 		 150 aa  130  9e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0314502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1526  hypothetical protein  41.1 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1997  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0838  hypothetical protein  40.15 
 
 		 418 aa  92  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174927  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0754  hypothetical protein  29.48 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.774812  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0324  N-6 DNA methylase  33.61 
 
 		 657 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00528654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0689  DNA methylase-type I restriction-modification system  30.16 
 
 		 687 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  30.17 
 
 		 815 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1224  N-6 DNA methylase  28.68 
 
 		 796 aa  44.3  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.708606 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.64 
 
 		 654 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0518055 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0921  N-6 DNA methylase  30.7 
 
 		 676 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  29.91 
 
 		 819 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3600  N-6 DNA methylase  28.21 
 
 		 738 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>