18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0315 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0315  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 		 125 aa  244  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1845  preprotein translocase, SecG subunit  72.41 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0822  preprotein translocase subunit SecG  36.59 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0720  preprotein translocase subunit SecG  35.83 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1628  preprotein translocase subunit SecG  41 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.732885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2085  preprotein translocase subunit SecG  33.06 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000374558  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00680  hypothetical protein  51.14 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5920  preprotein translocase, SecG subunit  38.96 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0413525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2731  preprotein translocase, SecG subunit  46.15 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  25.98 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  25.98 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  30.7 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1531  preprotein translocase subunit SecG  31.73 
 
 		 117 aa  42  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  26.67 
 
 		 123 aa  42  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  31.76 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  26.05 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  31 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  28.44 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>