21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_R0014 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_R0014  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  176  6e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00454198  hitchhiker  6.07507e-16 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0033  tRNA-Ser  93.26 
 
 		 89 bp  129  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0031  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 89 bp  89.7  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.137848  normal  0.0108409 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0025  tRNA-Ser  87.78 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0029  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  69.9  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0017  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  69.9  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544015  hitchhiker  0.0000175042 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 		 101 bp  67.9  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.329697  hitchhiker  0.00107888 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0030  tRNA-Ser  85.39 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0018  tRNA-Ser  85.39 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0150168  hitchhiker  0.0000162071 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0003  tRNA-OTHER  97.22 
 
 		 103 bp  63.9  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0822351  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0007  tRNA-Ser  84.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0031  tRNA-Ser  84.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.334076  hitchhiker  0.00102641 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0010  tRNA-OTHER  100 
 
 		 130 bp  58  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0030  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0029  tRNA-OTHER  94.44 
 
 		 117 bp  56  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0018  tRNA-OTHER  94.29 
 
 		 110 bp  54  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0019  tRNA-Phe  100 
 
 		 109 bp  50.1  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0014  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0005  tRNA-Phe  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0040  tRNA-Phe  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.738588 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0023  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.135769  normal  0.832903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>