20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2457 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2457  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  247  4e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0662521  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1691  hypothetical protein  82.91 
 
 		 119 aa  201  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0480  hypothetical protein  78.63 
 
 		 119 aa  190  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1586  hypothetical protein  77.12 
 
 		 121 aa  188  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4161  hypothetical protein  49.11 
 
 		 130 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1946  hypothetical protein  43.97 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000249775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1939  hypothetical protein  41.67 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00181312  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1913  hypothetical protein  41.53 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000103196  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2380  hypothetical protein  40.68 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000201201  normal  0.45808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3882  hypothetical protein  49.45 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0370234  normal  0.0307082 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1906  hypothetical protein  38.18 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0571  hypothetical protein  37.72 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1907  hypothetical protein  35 
 
 		 210 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978893  normal  0.652925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1222  hypothetical protein  83.33 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1803  hypothetical protein  27.72 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.986795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  32.32 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2625  hypothetical protein  47.73 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.939105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3985  hypothetical protein  29.7 
 
 		 140 aa  41.2  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4223  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.279869  hitchhiker  0.00388236 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1212  hypothetical protein  39.66 
 
 		 140 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.407451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>