21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2089 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2089  UspA domain protein  100 
 
 		 298 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2161  UspA domain-containing protein  58.99 
 
 		 280 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.551312  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2491  UspA domain protein  55.47 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0297  hypothetical protein  51.64 
 
 		 273 aa  251  7e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164486 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2124  hypothetical protein  46.81 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00183225 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1921  UspA domain protein  42.6 
 
 		 290 aa  207  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0824  UspA domain protein  34.12 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0929025  normal  0.400518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1928  hypothetical protein  33.22 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.101794  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1516  UspA domain-containing protein  28.15 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.360246  normal  0.6745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1016  UspA domain-containing protein  29.67 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1718  UspA domain-containing protein  32.75 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0741  hypothetical protein  37.75 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560909 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  28.49 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  33.17 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  26.92 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  29.52 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  26.49 
 
 		 142 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  33.83 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  26.64 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  39.58 
 
 		 415 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 156 aa  42.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>