More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0463 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_r03  23S ribosomal RNA  91.72 
 
 		 3163 bp  2147    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0463  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2891 bp  5731    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.815626  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0034  23S ribosomal RNA  87.44 
 
 		 2911 bp  2722    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0154  23S ribosomal RNA  92.74 
 
 		 2781 bp  2103    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r02  23S ribosomal RNA  91.72 
 
 		 3163 bp  2147    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r05  23S ribosomal RNA  91.72 
 
 		 3163 bp  2147    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2338  23S ribosomal RNA  93.57 
 
 		 2888 bp  1901    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0040  23S ribosomal RNA  98.35 
 
 		 3045 bp  3146    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.339342  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1727  23S ribosomal RNA  98.15 
 
 		 2796 bp  2882    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1714  23S ribosomal RNA  98.09 
 
 		 2795 bp  2866    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj23SA  23S ribosomal RNA  98.47 
 
 		 3063 bp  3162    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj23SB  23S ribosomal RNA  98.47 
 
 		 3063 bp  3162    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj23SC  23S ribosomal RNA  98.47 
 
 		 3063 bp  3162    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1798  23S ribosomal RNA  92.2 
 
 		 2894 bp  1762    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0052  23S ribosomal RNA  87.44 
 
 		 2911 bp  2722    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0039  23S ribosomal RNA  87.44 
 
 		 2911 bp  2722    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2341  23S ribosomal RNA  93.57 
 
 		 2888 bp  1901    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0520  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2891 bp  5731    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1462  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2891 bp  5731    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1801  23S ribosomal RNA  92.2 
 
 		 2894 bp  1762    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.267192  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1804  23S ribosomal RNA  92.2 
 
 		 2894 bp  1762    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2337  23S ribosomal RNA  93.57 
 
 		 2888 bp  1901    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.49451  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0020  23S ribosomal RNA  87.98 
 
 		 2884 bp  973    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0024  23S ribosomal RNA  87.98 
 
 		 2885 bp  973    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0033  23S ribosomal RNA  87.98 
 
 		 2884 bp  973    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0057  23S ribosomal RNA  87.98 
 
 		 2884 bp  973    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.389269  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1520  23S ribosomal RNA  98.35 
 
 		 3084 bp  3146    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.614168  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1264  23S ribosomal RNA  98.35 
 
 		 3084 bp  3146    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1707  23S ribosomal RNA  98.09 
 
 		 2794 bp  2874    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0594  23S ribosomal RNA  92.74 
 
 		 2781 bp  2103    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0508  23S ribosomal RNA  92.74 
 
 		 2781 bp  2103    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0295614  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0057  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 		 2640 bp  539  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0047  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 		 2640 bp  539  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0038  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 		 2640 bp  539  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.100102 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0028  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 		 2907 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0055  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 		 2907 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.940507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0016  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 		 2907 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.921086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0141  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 		 2907 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.030132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0031  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 		 2907 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000296907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0060  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 		 2908 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0004  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 		 2908 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0072  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 		 2907 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0011  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 		 2907 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0091  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 		 2907 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0063  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 		 2908 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0069  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 		 2908 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0066  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 		 2907 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0037  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 		 2902 bp  531  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0039  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 		 2634 bp  531  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0059  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 		 2653 bp  531  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0816838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0046  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 		 2902 bp  531  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0057  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 		 2902 bp  531  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0048  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 		 2634 bp  531  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5739  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2908 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5745  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2909 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00582654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5748  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2908 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2909 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2909 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2908 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5760  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2908 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5763  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2908 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5772  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2926 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000735902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-3  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2851 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-4  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-5  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-6  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-8  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2912 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2912 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2912 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.701116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2911 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SA  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2908 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SB  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2908 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SC  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2908 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SD  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2908 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000431114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SE  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2908 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.842717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SF  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2908 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SH  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2908 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SJ  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2908 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00026047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SK  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2908 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00794568  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0021  23S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 2850 bp  523  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.335485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0036  23S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 2850 bp  523  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0031  23S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 2850 bp  523  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>