19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2967 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2967  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 139 aa  268  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3141  anti-sigma-factor antagonist  66.99 
 
 		 128 aa  147  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.129085  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35230  STAS domain-containing protein  62.39 
 
 		 123 aa  133  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4123  anti-sigma-factor antagonist  55.88 
 
 		 136 aa  110  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3639  anti-sigma-factor antagonist  51.49 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2419  anti-sigma-factor antagonist  43.68 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3203  anti-sigma-factor antagonist  38.55 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15210  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  35.44 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2050  anti-sigma-factor antagonist  43.9 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0122  anti-sigma-factor antagonist  43.64 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  39.53 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0085  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1305  anti-sigma-factor antagonist  37.36 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427492  decreased coverage  0.000306808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.53 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01250  anti-anti-sigma factor  35.62 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0298  anti-sigma-factor antagonist  38.82 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  34.52 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>