41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0506 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0506  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000252365 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2804  integral membrane protein  26.09 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2783  hypothetical protein  26.09 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0781526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2762  integral membrane protein  25.54 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.342781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2530  integral membrane protein  25.54 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000539484 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2555  hypothetical protein  26.78 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.011471  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1274  hypothetical protein  30.9 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.28471  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3191  hypothetical protein  34.69 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3805  hypothetical protein  33.08 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.404034  normal  0.773364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3289  hypothetical protein  33.08 
 
 
236 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0260  hypothetical protein  37.8 
 
 
203 aa  62  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2177  hypothetical protein  32.85 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.359775  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4672  hypothetical protein  33.08 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.178311  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0635  hypothetical protein  32.17 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0911562  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0473  hypothetical protein  29.19 
 
 
211 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.690189  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3616  hypothetical protein  31.39 
 
 
236 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2372  hypothetical protein  29.19 
 
 
211 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0588117  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2511  hypothetical protein  29.19 
 
 
211 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1802  hypothetical protein  29.19 
 
 
211 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3911  hypothetical protein  31.39 
 
 
236 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4455  hypothetical protein  31.39 
 
 
236 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.554622  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0824  integral membrane protein  29.19 
 
 
211 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.701818  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0424  hypothetical protein  29.19 
 
 
211 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0275  hypothetical protein  28.43 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1329  hypothetical protein  31.79 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.385927  hitchhiker  0.00262088 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32420  hypothetical protein  35.14 
 
 
221 aa  52  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02190  hypothetical protein  34.87 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22720  hypothetical protein  28.75 
 
 
243 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19750  hypothetical protein  32.63 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00552394  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5984  hypothetical protein  31.64 
 
 
227 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.450186 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0105  hypothetical protein  32.43 
 
 
221 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136053  normal  0.0348722 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2236  hypothetical protein  38.28 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.112154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2553  hypothetical protein  37.9 
 
 
207 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.284006  normal  0.21762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2278  hypothetical protein  37.9 
 
 
207 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal  0.0474109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2415  hypothetical protein  30.07 
 
 
235 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4779  hypothetical protein  32.73 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1212  hypothetical protein  32.17 
 
 
255 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194441  normal  0.436437 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4177  hypothetical protein  29.63 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0511  hypothetical protein  37.21 
 
 
217 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0555837  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3812  hypothetical protein  27.06 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00260  hypothetical protein  32.92 
 
 
242 aa  42.4  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>