14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2515 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2515  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  787    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0062  hypothetical protein  21.67 
 
 
424 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1908  hypothetical protein  22.36 
 
 
413 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0595  hypothetical protein  20.96 
 
 
370 aa  53.5  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.28067 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2793  hypothetical protein  19.27 
 
 
393 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1153  hypothetical protein  21.23 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0087  hypothetical protein  22.37 
 
 
422 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0709  hypothetical protein  22.11 
 
 
372 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3358  hypothetical protein  28.24 
 
 
390 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0101  hypothetical protein  20.44 
 
 
366 aa  46.6  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.867237  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2829  hypothetical protein  20.53 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2955  hypothetical protein  23.24 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202209  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2654  hypothetical protein  24.58 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113589  normal  0.0183141 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2336  hypothetical protein  24.22 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0189612 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>