15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5242 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010335  Caul_5242  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  453  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.577822 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1765  hypothetical protein  43.1 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.97626  normal  0.455491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02159  hypothetical protein  36.13 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2454  hypothetical protein  34.43 
 
 
767 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0594275  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2224  hypothetical protein  31.97 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1361  hypothetical protein  30.63 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3643  hypothetical protein  28.4 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1115  hypothetical protein  31.33 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1525  hypothetical protein  31.33 
 
 
188 aa  62.8  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1944  hypothetical protein  36.19 
 
 
191 aa  62.4  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2021  hypothetical protein  29.93 
 
 
191 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3388  hypothetical protein  33.33 
 
 
756 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6186  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0767  hypothetical protein  25.14 
 
 
218 aa  52  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.635785  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06320  hypothetical protein  27.05 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5573  hypothetical protein  28.46 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>