15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4744 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4744  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
396 aa  803    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.732215  hitchhiker  0.0052696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3194  FAD dependent oxidoreductase  57.1 
 
 
390 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.329567  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03030  D-amino acid oxidase  49.03 
 
 
404 aa  322  7e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4743  FAD dependent oxidoreductase  41.03 
 
 
382 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3809  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 
273 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09913  putative D-amino acid oxidase  29.28 
 
 
311 aa  65.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1168  D-aspartate oxidase  27.96 
 
 
318 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.680607 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00174  D-amino acid oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G11290)  49.02 
 
 
364 aa  53.1  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11934  D-amino acid oxidase aao  26.51 
 
 
320 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0526  D-amino acid oxidase  25.9 
 
 
326 aa  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5336  predicted protein  40.24 
 
 
310 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00372413  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4180  D-aspartate oxidase  28.52 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251055  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10863  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G13940)  27.03 
 
 
347 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8818  D-aspartate oxidase  27.05 
 
 
371 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3499  D-amino-acid oxidase  24.64 
 
 
305 aa  42.7  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>