23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3925 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3925  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  637    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3700  hypothetical protein  33.1 
 
 
363 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130422  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3487  hypothetical protein  29.39 
 
 
364 aa  129  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0911  hypothetical protein  29.58 
 
 
291 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0071  hypothetical protein  23.98 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0643  hypothetical protein  29.45 
 
 
356 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3358  hypothetical protein  31.21 
 
 
337 aa  56.6  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4621  hypothetical protein  27.56 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5789  hypothetical protein  23.67 
 
 
336 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.856799  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3393  hypothetical protein  25.53 
 
 
336 aa  53.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3588  hypothetical protein  27.03 
 
 
351 aa  52.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3469  hypothetical protein  31.69 
 
 
333 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1041  hypothetical protein  22.49 
 
 
338 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2109  hypothetical protein  25.13 
 
 
338 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4825  hypothetical protein  27.07 
 
 
366 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.923521  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2309  hypothetical protein  25.34 
 
 
338 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00941536  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2449  hypothetical protein  24.43 
 
 
356 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000884224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1287  hypothetical protein  25.68 
 
 
378 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143964  normal  0.0342007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2773  hypothetical protein  25.14 
 
 
357 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3964  hypothetical protein  27.05 
 
 
322 aa  46.2  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4297  hypothetical protein  24.52 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0574  hypothetical protein  24.2 
 
 
367 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13100  hypothetical protein  24.03 
 
 
360 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>