86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2758 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2758  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  100 
 
 		 145 aa  301  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000797567 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1412  hypothetical protein  40.71 
 
 		 141 aa  90.5  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.827617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2298  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.75 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.622253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0840  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.62 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2168  hypothetical protein  34.62 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.327259  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4549  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.48 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.357845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2240  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.33 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.557008  hitchhiker  0.00154379 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4603  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.7 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2193  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.35 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1238  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.21 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117869 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2821  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.57 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4402  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.37 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2138  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.48 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1696  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.94 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304839 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1823  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.94 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.921331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3297  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.5 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1629  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  36.47 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1513  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.94 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000951  gfa-like protein  34.67 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1763  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.94 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0328446 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1760  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.94 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.119906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1500  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.91 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.033811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0248  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.77 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.286799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2367  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.71 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1607  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.71 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363316  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03248  hypothetical protein  36 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3374  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.5 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0127  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.33 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.857324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1704  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.07 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4872  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.71 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583204  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3070  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.17 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107279  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2158  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.17 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0585647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3597  hypothetical protein  34.67 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0067  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.33 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0087  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.67 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4268  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.67 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0084  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.67 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0087  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.67 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5543  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0635  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.12 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0219  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.93 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.655327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1191  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.91 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1478  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.67 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0084  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.67 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3305  hypothetical protein  27.55 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0278022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2548  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.73 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2003  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.61 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0088  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.67 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2663  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.6 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692714  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2052  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.6 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03740  hypothetical protein  29.89 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183645  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2565  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.1 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1551  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.55 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1697  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.63 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.066667  normal  0.902632 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2692  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.6 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0878  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.91 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2241  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.53 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.451684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4074  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.21 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1218  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.29 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413916  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1697  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.29 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342973  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2724  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.71 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2056  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.49 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.240914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2117  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.45 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0449559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0922  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.67 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0081  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.33 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4183  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.79 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0947549 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4109  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.53 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.055952  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5355  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.32 
 
 		 115 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.922702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2164  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.16 
 
 		 119 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3630  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.25 
 
 		 115 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380567  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1548  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  36.9 
 
 		 123 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.189147 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5991  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.53 
 
 		 115 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2588  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.37 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2417  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.61 
 
 		 115 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1706  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2699  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.72 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4277  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.97 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2716  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.53 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1576  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.33 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.899394  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1669  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  36.05 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2040  hypothetical protein  31.65 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288241  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1052  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.67 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0753  hypothetical protein  28.44 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222044  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2957  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.66 
 
 		 115 aa  40  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.383141  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1962  hypothetical protein  31.25 
 
 		 135 aa  40  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>