15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0224 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0224  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  352  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.983622  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_004310  BR1486  hypothetical protein  45.74 
 
 
172 aa  100  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1441  hypothetical protein  45.74 
 
 
172 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2971  hypothetical protein  43.2 
 
 
163 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1254  membrane protein-like  41.73 
 
 
172 aa  86.7  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.336737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3407  hypothetical protein  40 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0066  hypothetical protein  40 
 
 
128 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2110  membrane protein-like protein  44.44 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0164736 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03690  predicted membrane protein  35.29 
 
 
162 aa  58.5  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2612  membrane protein-like protein  36.36 
 
 
178 aa  51.6  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00392966 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23100  predicted membrane protein  38.53 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.121843  normal  0.492875 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4112  putative integral membrane protein  36.19 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2903  membrane protein-like protein  34.48 
 
 
169 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.459187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2265  membrane protein-like protein  30.93 
 
 
186 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953677  normal  0.0891239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3822  hypothetical protein  35.09 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>