18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2313 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2313  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  100 
 
 		 142 aa  283  7e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.28745  normal  0.0872129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2314  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  72.32 
 
 		 180 aa  137  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.532364  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2316  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  91.3 
 
 		 194 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.639181  normal  0.0504473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2310  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  91.95 
 
 		 194 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal  0.097877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2309  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  91.95 
 
 		 194 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  0.096958 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2317  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  77.78 
 
 		 180 aa  123  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.821282  normal  0.0230732 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2312  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  76.67 
 
 		 180 aa  119  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.092004 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2315  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  73.56 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.049134 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2311  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  75.86 
 
 		 180 aa  114  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.65355  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1063  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  44.44 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6553  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  40.3 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000129016  normal  0.35741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1293  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  40.35 
 
 		 174 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542493 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1496  sigma 28 (flagella/sporulation)  37.29 
 
 		 270 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0309  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.71 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745731 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5063  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  39.66 
 
 		 184 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2873  sigma-70 region 4 domain-containing protein  41.89 
 
 		 171 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208469  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6736  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  43.64 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0238  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.33 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>