68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1682 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1682  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
117 aa  239  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0710  transcriptional regulator, ArsR family  54.08 
 
 
111 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_002950  PG2225  hypothetical protein  50.67 
 
 
89 aa  84  7e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1599  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.556289  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2689  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 
126 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1426  hypothetical protein  40.48 
 
 
119 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1300  transcriptional regulator  44.21 
 
 
106 aa  77  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.223469  normal  0.471432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  43.33 
 
 
99 aa  77  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0060  regulatory protein, ArsR  42.34 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1165  hypothetical protein  41.98 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1413  transcriptional regulator  39.33 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.946834  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0081  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  36.54 
 
 
103 aa  72  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0308  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  41.25 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.762623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3477  MarR/EmrR family transcriptional regulator  42.7 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7857  hypothetical protein  39.09 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739073  normal  0.172696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4102  transcriptional regulator  40.62 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404387  normal  0.0188241 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4596  hypothetical protein  40 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505761  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4026  hypothetical protein  44.05 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.252958 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3450  hypothetical protein  44.58 
 
 
101 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1698  transcriptional regulator  36.54 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354656  normal  0.781335 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1598  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 
326 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2000  transcriptional regulator  38.2 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1486  hypothetical protein  35.48 
 
 
104 aa  67  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0003803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1630  putative transcriptional regulator  40.19 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.917024  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36190  hypothetical protein  43.16 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4430  hypothetical protein  45.68 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0470  hypothetical protein  41.51 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0242594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4062  hypothetical protein  45.68 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4544  hypothetical protein  45.68 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.234964  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0548  transcriptional regulator  40 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0542842  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2542  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  36.46 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0791599  normal  0.380837 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1247  putative PAS/PAC sensor protein  37.65 
 
 
327 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.977121  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0230  putative PAS/PAC sensor protein  35.56 
 
 
325 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0952  hypothetical protein  36.9 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.411513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2593  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0562  putative PAS/PAC sensor protein  38.82 
 
 
332 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0611  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  37.89 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.254501 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0889  putative transcriptional regulator  35.56 
 
 
95 aa  62  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343594  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1114  regulatory protein MarR  40 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0481626  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1028  putative PAS/PAC sensor protein  33.71 
 
 
330 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1862  hypothetical protein  40.54 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361874  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0125  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 
104 aa  60.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1018  putative PAS/PAC sensor protein  35.8 
 
 
332 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.377599  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0803  hypothetical protein  41.98 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.80068 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1252  putative PAS/PAC sensor protein  32.58 
 
 
303 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1184  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6424  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  41.24 
 
 
102 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4065  hypothetical protein  37.36 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.686189  normal  0.326424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3137  hypothetical protein  35.71 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.581839  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1413  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  35.35 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22783  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5349  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  39.47 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1352  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 
101 aa  53.5  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.182081  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2191  regulatory protein, ArsR  39.8 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0592  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.751987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3014  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  35 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0765911 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0771  hypothetical protein  43.06 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4140  hypothetical protein  35 
 
 
109 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.609006 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0953  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0139  transcriptional regulator  33.75 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0422  transcriptional regulator  29.07 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0239  hypothetical protein  30.77 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15068  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2579  transcriptional regulator  28.42 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4890  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.040811  normal  0.40753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4271  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350717  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3273  transcriptional regulator  37.5 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5191  putative transcriptional regulator  34.57 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0331978  normal  0.592256 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30320  hypothetical protein  35.14 
 
 
121 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03040  hypothetical protein  38.89 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>