20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_2017 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_2017  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  238  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.870487  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0028  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  54.74 
 
 
101 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0842094  normal  0.917965 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0026  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  61.64 
 
 
102 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0046  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  52 
 
 
105 aa  104  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0045  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  61.04 
 
 
105 aa  102  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0018  hypothetical protein  58.54 
 
 
109 aa  100  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.313448 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0047  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  52.08 
 
 
101 aa  98.6  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1993  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  53.42 
 
 
104 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0222  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  42.31 
 
 
93 aa  53.5  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1046  hypothetical protein  40.3 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746008  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1599  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.97 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.324886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3508  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.07 
 
 
91 aa  46.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349505  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2904  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.54 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.953268 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13473  hypothetical protein  35.29 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.928453  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0009  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4494  ATP-dependent Clp protease adaptor  32.53 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3811  ATP-dependent Clp protease adaptor  34.48 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0299236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1753  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.5 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1729  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.5 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.94 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>