44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0271 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  184  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1246  hypothetical protein  60.76 
 
 
103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1439  hypothetical protein  58.97 
 
 
81 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.766966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1018  hypothetical protein  58.67 
 
 
106 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0568  hypothetical protein  52.44 
 
 
91 aa  101  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2500  hypothetical protein  45.21 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00388461  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2376  hypothetical protein  44.87 
 
 
80 aa  73.6  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3956  hypothetical protein  43.48 
 
 
79 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2137  hypothetical protein  47.06 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.309843  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  36 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  35.06 
 
 
90 aa  62.8  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1329  Protein of unknown function DUF2442  41.67 
 
 
79 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1342  hypothetical protein  36.99 
 
 
80 aa  62  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1387  hypothetical protein  36.99 
 
 
80 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1569  hypothetical protein  36.25 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.997179  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0903  hypothetical protein  42.31 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.50164  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3622  hypothetical protein  31.17 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0240  hypothetical protein  30.49 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1993  hypothetical protein  33.75 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0558528  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2429  hypothetical protein  34.67 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0492  hypothetical protein  34.21 
 
 
97 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29977  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2568  hypothetical protein  33.78 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0192  hypothetical protein  33.8 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.77367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1650  hypothetical protein  31.46 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00619  hypothetical protein  31.08 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1285  hypothetical protein  32.81 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1403  hypothetical protein  32.81 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1211  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  33.33 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56263  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1066  hypothetical protein  24.72 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3398  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  26.19 
 
 
89 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4194  hypothetical protein  29.87 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0923  hypothetical protein  34.92 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5000  hypothetical protein  32.35 
 
 
74 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1900  hypothetical protein  35.48 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.030985 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0662  hypothetical protein  35.62 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.6245  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0654  hypothetical protein  35.62 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.169854  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0617  hypothetical protein  34.33 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0906  hypothetical protein  30 
 
 
86 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.866498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0622  hypothetical protein  30.91 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000178223  unclonable  0.0000000000835363 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1410  hypothetical protein  28.21 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.314119  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2658  hypothetical protein  22.22 
 
 
81 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0823788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0265  hypothetical protein  25 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1477  hypothetical protein  27.06 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>