9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8296 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8296  integral membrane protein  100 
 
 		 457 aa  889    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06740  hypothetical protein  25.28 
 
 		 495 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00180  hypothetical protein  27.88 
 
 		 489 aa  67  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8939  hypothetical protein  25.78 
 
 		 523 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00366232  normal  0.183777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1339  hypothetical protein  21.8 
 
 		 570 aa  57  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0036  hypothetical protein  25.82 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3324  hypothetical protein  25.29 
 
 		 511 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0108398  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0442  hypothetical protein  24.3 
 
 		 485 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5433  hypothetical protein  23.62 
 
 		 483 aa  43.5  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>