13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8051 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8051  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
434 aa  865    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.761196  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0402  Pyrrolo-quinoline quinone  42.86 
 
 
531 aa  236  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2697  legume lectin beta domain protein  35.15 
 
 
1236 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0132334  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  31.13 
 
 
1192 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4776  hypothetical protein  26.1 
 
 
841 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174765  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1154  hypothetical protein  27.19 
 
 
727 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00101932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1484  hypothetical protein  28.53 
 
 
1128 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1628  hypothetical protein  29.7 
 
 
612 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3192  hypothetical protein  25.96 
 
 
596 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105829  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0774  hypothetical protein  25.83 
 
 
586 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  25.47 
 
 
574 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.254768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1148  Ig-like, group 2  23.88 
 
 
683 aa  53.5  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.828314  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6636  Pyrrolo-quinoline quinone  25.38 
 
 
577 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>