20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8040 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8040  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  344  4e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3445  hypothetical protein  33.78 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.815991  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1365  secreted protein  31.76 
 
 
171 aa  54.3  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866634  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2791  hypothetical protein  32.26 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.688451  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4218  hypothetical protein  32.87 
 
 
200 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19108  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4042  hypothetical protein  33.83 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.119824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8007  hypothetical protein  31.79 
 
 
145 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1976  hypothetical protein  34.92 
 
 
177 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524667  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1910  hypothetical protein  34.92 
 
 
177 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1930  hypothetical protein  34.92 
 
 
195 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.900616  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12995  hypothetical protein  31.88 
 
 
181 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00625198  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1486  hypothetical protein  32.21 
 
 
191 aa  48.5  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0685167  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11170  hypothetical protein  31.76 
 
 
158 aa  48.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0582043  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0641  hypothetical protein  30.22 
 
 
156 aa  47.8  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2149  hypothetical protein  30.22 
 
 
207 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2309  hypothetical protein  34.85 
 
 
155 aa  44.7  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000375151  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1129  hypothetical protein  32.85 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0202  hypothetical protein  26.81 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2109  hypothetical protein  34.17 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1679  hypothetical protein  32.56 
 
 
157 aa  42  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0785238  hitchhiker  0.00456336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>